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Socios coordinadores

Cath Brooksbank es el investigador principal de CABANA. Como jefe de capacitación en EMBL-EBI, Cath es responsable de la coordinación estratégica de su programa de capacitación. Su equipo trabaja con expertos y científicos de EMBL-EBI en todo el mundo para brindar capacitación concisa y específica sobre temas relacionados con la bioinformática. 

Email: cath [at] ebi.ac.uk

Tel:+44 (0)1223 492 525 / Fax:+44 (0)1223 494 468

Ian Willis es el gerente de proyectos de CABANA. Ian tiene experiencia en proyectos de desarrollo internacional que van desde la instalación de saneamiento hasta la salud pública.

 Email: ian [at] ebi.ac.uk
Piv Gopalasingam es un Oficial de Capacitación Científica para el Equipo de Capacitación y es el principal responsable del desarrollo científico y la entrega de capacitación dentro del proyecto CABANA. Es instructor de Train the Trainer y tiene interés en la comunicación científica, el desarrollo comunitario, la igualdad, la diversidad y la inclusión.

Email: piv [at] ebi.ac.uk

Tel::+ 44 (0) 1223 49 2548 / Fax:+ 44 (0) 1223 494 468

Claire Johnson es Gerente Senior de Proyectos Científicos cuyo enfoque es mejorar las oportunidades y el reconocimiento para el desarrollo profesional continuo de los profesionales. Actualmente gestiona la contribución de EMBL-EBI al proyecto RItrain, cuya misión es mejorar y profesionalizar la capacitación del personal directivo y de liderazgo en infraestructuras de investigación (RI).

Claire también brinda apoyo de difusión a CABANA, un proyecto de fortalecimiento de capacidades para bioinformática en América Latina.

Email: claire [at] ebi.ac.uk

Tel:+ 44 (0) 1223 494 566 / Fax:+ 44 (0) 1223 492 621

Prakash Singh es desarrollador web en EMBL-EBI. Está ayudando en el desarrollo y mantenimiento del sitio web de CABANA y el portal de elearning.

Email: prakash [at] ebi.ac.uk

Tel:+44 (0) 1223 49 4616

Socios latinoamericanos

  Marco Cristancho es profesor asociado en la Universidad de los Andes, Bogotá, Colombia. Con más de 13 años de experiencia en bioinformática y más de 20 años de experiencia en genómica, biología molecular y mejora del café, el liderazgo de Marco en bioinformática en Colombia es bien reconocido. Ha participado en una gran cantidad de esfuerzos de colaboración nacionales e internacionales y es un líder experimentado de grandes proyectos y grupos científicos. Asesora en las áreas de Genómica, Bioinformática y Control de Patógenos Vegetales para Institutos de Investigación públicos y privados en Colombia y en el extranjero. Su enfoque actual es el liderazgo de proyectos de investigación bioinformática con alto impacto en Colombia en las áreas de salud, biodiversidad y agricultura.  Email: ma.cristancho29@uniandes.edu.co
  Adrian Turjanski es Profesor de Bioinformática en la Universidad de Buenos Aires y Director de la Plataforma Argentina de Bioinformática. También ha ayudado a dirigir la Membresía Asociada de Argentina del Laboratorio Europeo de Biología Molecular. Las becas de visita y los cursos cortos de capacitación son una parte integral de la membresía de EMBL en Argentina, por lo que Adrián tiene experiencia directa sobre el impacto que pueden tener tales iniciativas de desarrollo de capacidades.  Email: adrian@qi.fcen.uba.ar
  Maximo Rivarola es Director de la Unidad de Bioinformática en el Instituto de Biotecnología en el Centro Nacional de Investigación Agrícola en el Instituto Nacional de Tecnologías Agrícolas (INTA) en Buenos Aires e investigador adjunto en Conicet; Como participante en el proyecto internacional DEANN, está bien conectado con la comunidad de análisis de datos NGS tanto dentro como fuera de América Latina. Participa activamente en varios proyectos que involucran el transcriptoma de novo y el ensamblaje del genoma, así como también estudios que involucran variantes genéticas en poblaciones para determinar la resistencia a enfermedades en cultivos agronómicos.  
Rebeca Campos Rebeca Campos-Sánchez es profesora de biología molecular, genómica y bioinformática en la Universidad de Costa Rica (UCR) desde 2005. Su objetivo ha sido ampliar y fortalecer la comunidad de bioinformática en Costa Rica, incluida la creación de RedBioAplicada para compartir con investigadores y estudiantes Diversas oportunidades de capacitación, financiamiento y estudio dentro del país y en el extranjero. Comenzó a desarrollar material de aprendizaje electrónico sobre bioinformática en español durante una comisión de servicio de CABANA de 6 meses con Cath Brooksbank y el equipo de capacitación de EMBL-EBI. En su investigación, se enfoca en comprender el desarrollo del microbioma desde la infancia y se aplica a enfermedades como el autismo, además está trabajando en la genómica evolutiva de elementos transponibles, entre otros temas.  
  Benilton Carvalho es profesor asistente en la Universidad Estadual de Campinas; él tiene una larga historia de colaboración con EMBL-EBI, habiendo contribuido en varias iteraciones de nuestro altamente considerado curso práctico EMBO sobre análisis de datos de secuenciación de alto rendimiento. Estadístico de formación, fundó la Iniciativa Brasileña sobre Medicina de Precisión, contribuye a la Alianza Global para la Genómica y la Salud, y es miembro del grupo de trabajo sobre el virus del Zika en el área de Sao Paulo.  
  Guilherme Oliveira es investigadora sénior en el Instituto de Tecnología de Vale - Desarrollo sostenible en la cuenca amazónica brasileña. Tiene redes de gran alcance en América Latina y más allá, después de haber sido presidente de la Asociación Brasileña de Bioinformática y Biología Computacional y miembro de la Junta de la Sociedad Internacional de Biología Computacional. Sus intereses de investigación actuales se encuentran en la ecología microbiana; También contribuyó al análisis del genoma de Schistosoma.  
Selene Fernandez Selene L. Fernández Valverde es investigadora principal del grupo de genómica funcional y evolutiva del ARN regulador en el Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad en México (Langebio-cinvestav). Su investigación se centra en genómica y bioinformática. Su principal interés académico es contribuir a la comprensión de los mecanismos involucrados en la amplia diversidad fenotípica presente en el reino animal y vegetal. Está particularmente interesada en el papel de los ARN no codificantes en la evolución de los paisajes reguladores dentro y entre especies.  
Alejandro Reyes Alejandro Reyes es profesor asociado en la Universidad de los Andes, en Bogotá, Colombia, donde también es líder del grupo Max Planck Tandem Group en biología computacional. Utilizando enfoques de biología computacional, desarrolla herramientas para el análisis de datos derivados de estudios ómicos (genómicos, transcriptómicos, metabólicos, etc.) para la caracterización de comunidades microbianas y sus interacciones con el medio ambiente. De particular interés es cómo las comunidades microbianas asociadas con los humanos, y en particular sus virus, afectan la salud humana.  
  Andrés Gatica es profesor en el Departamento de Biología de la Universidad de Costa Rica. Sus intereses de investigación radican en la mejora genética de plantas de cultivo económicamente importantes, incluido el café.  
Norma Paniego Norma Paniego es investigadora en el Instituto de Biotecnología de CICVyA (INTA) e investigadora asociada en el Consejo Nacional de Investigación Científica y Técnica (CONICET), desde 2006. Actualmente coordina la consolidación de bioinformática PPR y PE INTA del sistema de información computarizado de Recursos genéticos y desarrollo de bancos de ADN. Además, es codirectora del grupo Sunflower Genomics y coordinadora de los servicios de Genómica General (secuenciación y genotipado) del Proyecto de Estructuración de Recursos Biológicos y Biotecnológicos.  
  Alfredo Herrera-Estrella es líder del Grupo en el Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad en México; Sus intereses de investigación incluyen el análisis de genomas de cultivos y de microorganismos, y tiene una larga trayectoria de tutoría de estudiantes y postdoctorados.  
  Jan Kreuze es virólogo molecular y científico principal del Centro Internacional de la Papa en Lima, Perú. Ha desarrollado métodos novedosos para descubrir virus y asesora a la comunidad mundial de mejoramiento de papa sobre los riesgos de enfermedades de transportar germoplasma de papa.  
Noelle Anglin Noelle Anglin es la Líder del Programa del Programa de Biodiversidad para el Futuro en el Centro Internacional de la Papa (CIP) en Lima, Perú. Tiene un doctorado en biología molecular y su trabajo se ha centrado en el desarrollo de marcadores para los esfuerzos de mejoramiento y las evaluaciones de diversidad genética de las colecciones de bancos de genes. El banco de genes del CIP conserva una gran colección clonal de papa, camote y raíces andinas y tubérculos (ARTC) y sus parientes silvestres. Ha contribuido a reforzar la visión del CIP de conservar, expandir, caracterizar y distribuir la mayor colección de raíces y tubérculos del mundo en beneficio de la humanidad.  
  Ricardo Fujita construyó y dirige el laboratorio nacional de referencia de genética humana en Perú y es un experto en enfermedades raras y evolución humana, además de haber asesorado a un gran número de investigadores en etapa temprana

 

 

Carlos Modenutti Carlos P. Modenutti es investigador postdoctoral en el Laboratorio de Física Bioquímica y Bioinformática Estructural de Proteínas (BFQyBE), perteneciente al Departamento de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires, IQUIBICEN-CONICET. Su principal línea de investigación se refiere al estudio de la posible sinergia entre los inhibidores similares a las drogas y las especies reactivas de oxígeno en el patógeno Mycobacterium tuberculosis. A su vez, es responsable de la División de Glicobiología de BFQyBE, donde se estudian aspectos relacionados con la predicción de fenómenos de interacción entre proteínas y carbohidratos.
 
 
Hannele Lindqvist-Kreuze Hannele Lindqvist-Kreuze es criadora molecular en el Centro Internacional de la Papa (CIP) en Lima, Perú, investigando la genómica de la papa y específicamente la resistencia al estrés biótico. Ella emprendió una comisión de servicio de CABANA con José De Vega y su equipo en el Instituto Earlham en el Reino Unido (enero de 2019 a abril de 2019) con un proyecto destinado a aumentar la capacidad del obtentor latinoamericano de cultivos autopoliploides en el uso de herramientas genómicas modernas en sus programas de mejora genética. Sus intereses de investigación actuales incluyen también cultivar parientes silvestres y cómo usar esta biodiversidad en el mejoramiento de la papa.  
Cei Abreu Goodger Cei Abreu-Goodger lidera el grupo de Genómica Computacional de ARN en el Laboratorio Nacional de Genómica para la Biodiversidad en México (Langebio-Cinvestav). En estrecha colaboración con grupos experimentales, utiliza enfoques computacionales para estudiar los efectos reguladores que los ARN pequeños tienen en la expresión génica. Está particularmente interesado en los ARN pequeños que pueden moverse entre especies, actuando potencialmente como una forma de comunicación. Durante 2019 fue becario postdoctoral visitante en el EMBL-European Bioinformatics Institute en el equipo de expresión génica, trabajando en la predicción de los efectos de microRNA a partir de experimentos de RNA-Seq de células individuales.
 
 
Tatiana Benaglia Tatiana Andrea Benaglia Carvalho tiene una licenciatura (2001) y una maestría (2004) en Estadística de la Universidad Estatal de Campinas (UNICAMP) y un doctorado en Estadística de la Universidad Estatal de Pensilvania (2008). Trabajó como investigadora asociada (2009-2012) en la Unidad de Bioestadística del Consejo de Investigación Médica en Cambridge, Reino Unido. Desde 2013 ha sido contratada como profesora de doctorado por el Departamento de Estadística de la Universidad Estatal de Campinas. Tiene experiencia en estadísticas no paramétricas, modelos de mezclas, modelos lineales y análisis de tecnologías sanitarias, especialmente análisis de costo-efectividad.  
Ronnie Alves Ronnie Alves concluiu Doutorado em Informática (Inteligência Artificial) pela Universidade do Minho sob a supervisão do Prof. Dr. Orlando Belo. Foi pesquisador visitante no grupo de Data Mining liderado pelo Prof. Dr. Jiawei Han na University of Illinois at Urbana Champaign e no grupo de Bioinformática (BIGS) da Universidade Pablo de Olavide liderado pelo Prof. Dr. Jesus Aguilar-Ruiz. Publicou diversos artigos em periódicos especializados e trabalhos em anais de eventos. Sua pesquisa tem ênfase na área de aprendizado de máquinas, mineração de dados e bioinformática. Realizou pós-doutoramento no Institut de Biologie Valrose (iBV) - CNRS/UMR6543, e no Instituto de Informática da UFRGS. Foi pesquisador convidado (Jeune Chercheur) no Institute de Biologie Computationnelle (IBC), do Lab. of Computer Science, Robotics and Microelectronics of Montpellier (LIRMM), Université Montpellier (UM); Membro do Comitê Gestor da Comissão Especial de Biologia Computacional (CE-BioComp) da Sociedade Brasileira de Computação (SBC). Atua como docente permanente no Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação da UFPA, e no Programa de Mestrado Profissional do Instituto Tecnológico Vale(ITV). Atua como Pesquisador Associado no grupo de Genômica Ambiental do ITV.