CABANA es un proyecto de fortalecimiento de capacidades para bioinformática en América Latina. Su objetivo es acelerar la implementación de la biología basada en datos en la región mediante la creación de un programa de creación de capacidad sostenible. CABANA está orquestada por un consorcio internacional de diez organizaciones: nueve en América Latina y una en el Reino Unido.

• CABANA está ayudando a acelerar la biología basada en datos en América Latina mediante la introducción de un programa sostenible para el desarrollo de capacidades en la región.

• La gama internacional y excepcionalmente amplia de actividades de CABANA se dirige a las necesidades de capacitación de las diversas comunidades de ciencias biológicas y biomédicas de América Latina.

• CABANA acelerará el uso de bioinformática en las instituciones líderes de la región, que se convertirán en centros en una red de bioinformática pan-latinoamericana..

• Está fortaleciendo la cooperación internacional y desarrollando colaboraciones transfronterizas para apoyar un mejor acceso a herramientas y recursos bioinformáticos, una mejor gestión de la información de calidad y una mejor capacidad de descubrimiento y anotación de datos biológicos relacionados con nuestras tres áreas de desafío. 

• CABANA está financiado por Global Challenges Research Fund (GCRF), parte del Presupuesto de Ayuda del Reino Unido, desde octubre de 2017 hasta diciembre de 2021.

 

Las tres áreas de desafío de CABANA

La biología basada en datos promete tener un gran impacto en la salud, la agricultura y la gestión ambiental. CABANA se centrará en tres desafíos. Estos desafíos son de importancia mundial, pero de particular relevancia en América Latina: enfermedades transmisibles, producción sostenible de alimentos y protección de la biodiversidad. 

Enfermedad transmisible

América Latina necesita encontrar soluciones para combatir las enfermedades tropicales desatendidas como el zika, el chikungunya, la malaria y el dengue. Dichas soluciones podrían seguir el camino tomado para abordar otras enfermedades importantes como el ébola en África. Un proyecto dirigido por la investigación del Reino Unido ha sido fundamental en el conocimiento del virus, el seguimiento de eventos epidémicos, limitando la propagación de la enfermedad y el desarrollo de tratamientos y el inicio de proyectos para desarrollar una vacuna. Una parte importante de este proyecto fue la secuenciación y el análisis bioinformático de los aislados del virus tomados en varios países africanos afectados por la enfermedad.

Además de comprender la composición genómica de los patógenos, las variaciones de secuencia en el organismo huésped pueden tener un impacto importante en la susceptibilidad a la infección y / o la gravedad del resultado final. El análisis de los datos del genoma humano enviados a las bases de datos públicas muestra que las poblaciones de ascendencia africana y latinoamericana, hispanos e indígenas apenas están representadas en los estudios de genómica. Dada la necesidad de tener datos del genoma de esas poblaciones para el desarrollo de la medicina de precisión en la práctica clínica, es necesario impulsar la recopilación de datos genómicos en las poblaciones latinoamericanas.

Producción sostenible de alimentos.

América Latina es un importante productor y exportador de carne, frutas, verduras, cacao y café. La producción de biocombustibles también está creciendo, siendo la caña de azúcar una fuente importante. Estas industrias son cruciales para el desarrollo de la región, pero ejercen una gran presión sobre la biodiversidad incomparable de América Latina, que no solo es de enorme importancia por derecho propio, sino que también contribuye a la prosperidad económica a través del ecoturismo. La biología basada en datos puede facilitar la producción de cultivos y ganado que son más resistentes a los desafíos ambientales.

Por ejemplo, la presencia de datos genómicos bien anotados y de alta cobertura en recursos de datos públicos como Ensembl, Ensembl Genomes y PhytoPath permite a los investigadores agroalimentarios responder preguntas como: qué genes influyen en la masa muscular, la calidad y el sabor en el ganado y pez; qué genes influyen en el valor potencial de un cultivo como fuente de biocombustibles o como biomasa; ¿Qué genes influyen en la susceptibilidad a las plagas o en ambientes extremos y qué vías influyen en el valor nutricional de los productos alimenticios? Si el aumento de las temperaturas globales continúa, será imperativo desarrollar cultivos que sean resistentes a la sequía, el agotamiento de la luz solar, las altas precipitaciones y las plagas y enfermedades emergentes. La región tiene varios grupos genéticos de plantas cultivadas que pueden buscarse para variedades resistentes adaptadas a las condiciones climáticas cambiantes, particularmente aquellas en regiones tropicales. Al involucrar activamente a la población investigadora latinoamericana en la captura, anotación y análisis de estos datos, construiremos colaboraciones duraderas que apoyarán el desarrollo futuro de la industria alimentaria basado en la investigación. 

Protección de la biodiversidad.

Los países latinoamericanos albergan más del 30% de la biodiversidad del mundo. Tenemos la tecnología para estudiar esta vasta biodiversidad de una manera rápida, eficiente y rentable que impulsará el uso sostenible de plantas, microbios y otras especies endémicas de esta parte del mundo, y nos dará información en tiempo real que permita nosotros para proteger algunas de las zonas más vulnerables del mundo. El crecimiento económico y el desarrollo a menudo están en conflicto directo con la preservación de la historia natural única de la región.

Solo entendiendo el impacto en la biodiversidad de las actividades impulsadas por el hombre, como la agricultura intensiva y la urbanización, podemos encontrar un equilibrio entre estas áreas en conflicto. Los proyectos que comparan el metagenoma o el metatranscriptoma a lo largo del tiempo o bajo diferentes condiciones ambientales nos ayudarán a tomar decisiones racionales y basadas en la evidencia para el desarrollo sostenible en nuestros países objetivo. 

Gobernancia

El proyecto se regirá por un Grupo Ejecutivo y un Grupo Asesor Independiente.

Grupo ejecutivo	Grupo asesor independiente	Flujos de trabajo
Project coordinator (Cath Brooksbank, UK) Co-coordinator (Marco Cristancho, CO) 5 National leads (AR, BR, CO, MX, PE) Project manager (Ian Willis, UK) Project officer (BBSRC, UK)	Ethics expert Inclusivity expert One expert on each challenging topic Training/ career development expert Representation from related GCRF project(s)	Research Secondments (Jan Kreuze, PE) Train-the-trainer (Adrian Turjanski, AR) Workshops (Guilherme Oliveira, BR) eLearning resources (Alejandro Reyes, CO) Dissemination & outreach (Cath Brooksbank, UK).

CABANA y sus datos personales

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