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César Prada Medina

César Prada Medina

PhD student
Home institute: University of São Paulo,
Country of residence: Brazil
Highest qualification: BSc
Name of the host: Irene Papatheodorou
Projects start date:
Relevant challenge area(s): Communicable disease
Projects end date:
Type of project: Software curation

César Prada Medina es Ph.D. estudiante de la Universidad de São Paulo, Brasil, en el Departamento de Análisis Clínicos, Facultad de Ciencias Farmacéuticas. Después de obtener su Licenciatura en Biología, trabajó en el Centro de Investigación de Enfermedades Tropicales (CINTROP) en Colombia y comenzó a seguir una carrera en Biología de Sistemas. La fusión de este objetivo con su experiencia biomédica permitió su encuentro con Helder Nakaya y su mayor adhesión al Laboratorio de Biología de Sistemas Computacionales.

Project summary

El objetivo era caracterizar mejor la heterogeneidad fisiopatológica de la enfermedad de la artritis idiopática juvenil (AIJ). Su investigación tiene como objetivo revelar los programas de expresión génica de leucocitos que impulsan la inflamación crónica en pacientes con AIJ. Al combinar el metanálisis estadístico y los principios de la red de medicina, espera contribuir a abordar una práctica clínica más personalizada en pacientes con AIJ.

Project outcomes and impact

En un esfuerzo conjunto con el equipo de Expression Atlas (EA), la mayoría de los estudios de expresión génica de Artritis Idiopática Juvenil (JIA) se pusieron a disposición a través de la base de datos Expression Atlas. Durante este proceso, se promovió una actualización en el repositorio de Ontología de Factor Experimental (EFO) con respecto a la clasificación JIA. Estos constituyen contribuciones permanentes a la comunidad científica. Además, la comisión de servicio sirvió para asegurar una colaboración entre el laboratorio de César, el Laboratorio de Biología de Sistemas Computacionales (CSBL) y el equipo de EA en torno al metanálisis de los estudios de expresión génica. El CSBL planea lanzar una herramienta web para realizar, bajo demanda, metaanálisis de expresión génica de datos disponibles públicamente, incluidos los recursos de EA.