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Agustin Pardo

PhD student
Home institute: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires
Country of residence: Argentina
Highest qualification: MSc
Name of the host: Henning Hermjakob
Projects start date:
Relevant challenge area(s): Communicable disease
Projects end date:
Type of project: Software curation

Agustín Pardo realizó su Maestría en Ciencias Biológicas en la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales de la Universidad de Buenos Aires. Durante su maestría, aplicó un enfoque multimómico, que tiene en cuenta la información estructural, metabólica y genómica con el objetivo de predecir nuevos objetivos moleculares de los patógenos humanos. Actualmente, realiza su doctorado en la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, en el departamento de Biología Química.

Project summary

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Como asistente de CABANA, Agustín trabajó en el grupo Reactome en EMBL-EBI. En la base de datos Reactome, hay pocas vías metabólicas de interacción humano-Mycobacterium tuberculosis. El proyecto de Agustín tenía como objetivo expandir y actualizar esas vías Reactome.

 

 

Project outcomes and impact

El tiempo en Reactome me ha dado experiencia en la curación de bases de datos para enfrentar nuevos procesos de curación basados ​​en diferentes enfoques. El resultado principal fue un rediseño y expansión de las vías de infección del huésped humano con Mycobacterium tuberculosis y la infección con Enterobacterias, adquiriendo una mejor comprensión del proceso de infección que será útil en mis próximos años trabajando con estos organismos. Espero que este trabajo, que se incluirá en la próxima versión de la base de datos Reactome, pueda ser útil como fuente para la comunidad que trabaja en tales infecciones humanas.
Como otro resultado de la comisión de servicio, se propuso un hackatón de curación de vías humanas / patógenas que podría llevarse a cabo como parte de un Taller CABANA "Explorando las redes biológicas y su aplicación en la salud y la enfermedad" con el objetivo de aumentar el conocimiento de las infecciones basadas en enfermedades humanas. sobre las perspectivas comunes de los expertos de los investigadores de la comunidad de patógenos de América Latina. Esperamos que el hackatón fortalezca las redes de bioinformática en América Latina conectando y creando vínculos entre investigadores de un tema de investigación.