Como miembro fundador del Banco Mundial de Datos de Proteínas (wwPDB), el Banco de Datos de Proteínas en Europa (PDBe) gestiona el archivo de la estructura biomacromolecular mundial, el Banco de Datos de Proteínas (PDB). Los socios de wwPDB aceptan y anotan deposiciones en todo el mundo de estructuras biomacromoleculares determinadas mediante cristalografía de rayos X, espectroscopía de resonancia magnética nuclear (NMR), microscopía electrónica en 3D (EM) y otros métodos de determinación de estructura. PDBe es miembro fundador de EMDataBank, que gestiona la deposición y anotación de datos EM en EMDB. PDBe tiene como objetivo garantizar que este importante recurso realmente atienda las necesidades de la comunidad biomédica.

El equipo PDBe, dirigido por el Dr. Sameer Velankar, trabaja para mejorar la interfaz web para que los usuarios puedan aprovechar al máximo las herramientas y servicios existentes. El equipo diseña nuevas herramientas según sea necesario para que los datos estructurales estén disponibles y sean accesibles para todos. En el contexto del proyecto SIFTS, el equipo integra datos estructurales con otros datos biológicos para facilitar el descubrimiento. Estos datos integrados forman la base de muchas interfaces de consulta que permiten presentar los datos de la estructura biomacromolecular en su contexto biológico. Las áreas de enfoque específicas son integridad de datos, calidad de datos, integración y diseminación de datos a la comunidad biomédica no experta.